Ahí, la suerte no acompañaría a los celestes y caerían 7-6, perdiendo de nueva cuenta el título. Cruz Azul mantendría la buena inercia que traía del Clausura y se lograría meter de nueva cuenta a la Final, esta vez ante el Toluca. El Clausura 2009 sería el peor torneo en la historia de Cruz Azul en la Primera División. 29 clubes entre todos los participantes históricos en la competición han conseguido proclamarse vencedores, mientras que 32 más para un total de 61 completan la lista de clubes con presencia en alguna final.
